Son Sistemas de Vida, Saberes y Cosmocimientos, que tienen relación directa con las funciones básicas de la docencia, la investigación, los servicios y extensión, son los siguientes:
Los Sistemas Bioculturales y Cosmocimientos.
Los Sistemas de la Organización Comunitaria, Familiar y Territorial.
Los Sistemas de Gobernanzas, Administración y Política.
Los Sistemas de Derecho, Jurisdicciones Especiales y Pluralismo Jurídico.
El Sistema del Agua y Territorio.
El Sistema Ambiental.
El Sistema de Energías Limpias.
Los Sistemas Productivos, Agroalimentarios y de Agrobiodiversidad.
Los Sistemas de Ingenierías y Bioconstrucción.
El Sistema de Educación Territorial.
El Sistema de Salud Propia y Medicinas Alternativas.
El Sistema de Economía Propia y Alternativas al Desarrollo.
El Sistema de Comunicación y Desarrollo Tecnológico.